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#reassortment

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Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Evidence" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Evidence</span></a> of novel <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> in clade 2.3.4.4b avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a> viruses, <a href="https://mstdn.science/tags/India" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>India</span></a>, 2024, <a href="https://etidiohnew.blogspot.com/2025/03/evidence-of-novel-reassortment-in-clade.html" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidiohnew.blogspot.com/2025/0</span><span class="invisible">3/evidence-of-novel-reassortment-in-clade.html</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>A <a href="https://mstdn.science/tags/human" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>human</span></a>-infecting <a href="https://mstdn.science/tags/H10N5" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H10N5</span></a> avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> virus: <a href="https://mstdn.science/tags/clinical" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>clinical</span></a> features, virus <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a>, <a href="https://mstdn.science/tags/receptor" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>receptor</span></a>-binding affinity, and possible <a href="https://mstdn.science/tags/transmission" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>transmission</span></a> routes, <a href="https://etidiohnew.blogspot.com/2025/03/a-human-infecting-h10n5-avian-influenza.html" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidiohnew.blogspot.com/2025/0</span><span class="invisible">3/a-human-infecting-h10n5-avian-influenza.html</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>Phylogenetic <a href="https://mstdn.science/tags/discordance" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>discordance</span></a> cannot identify <a href="https://mstdn.science/tags/genomic" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>genomic</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> events: a case study with the avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> virus <a href="https://mstdn.science/tags/H5Nx" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5Nx</span></a>, <a href="https://etidiohnew.blogspot.com/2025/03/phylogenetic-discordance-cannot.html" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidiohnew.blogspot.com/2025/0</span><span class="invisible">3/phylogenetic-discordance-cannot.html</span></a></p>
Don Trueten :antifa:<p><strong>Die Vogelgrippe-Situation hat sich nur verschlechtert</strong></p> <strong>Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Vogelgrippe" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Vogelgrippe</span></a> <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a> war bisher eine Krise, die langsam brodelte. Die Situation verschlechterte sich im Jahr 2021, als Vögel das Virus von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Europa" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Europa</span></a> nach <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Amerika" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Amerika</span></a> brachten, was eine Wiederholung von 2014 war, als asiatische Zugvögel in den Vereinigten Staaten und <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Kanada" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Kanada</span></a> weit verbreitete Ausbrüche auslösten. Beide Ereignisse führten zu einer <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Masseninfektion" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Masseninfektion</span></a> von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Hausgefl%C3%BCgel" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Hausgeflügel</span></a> und zur Keulung von Millionen von Hühnern. Die Ausbrüche, die 2021 begannen und bis heute andauern, weisen jedoch eine zusätzliche Besonderheit auf: Dieses Mal sind auch <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/S%C3%A4ugetiere" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Säugetiere</span></a> wie <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Robben" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Robben</span></a> und <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gro%C3%9Fkatzen" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Großkatzen</span></a> in großer Zahl infiziert worden und wurden tot an Stränden, in Zoos und anderswo aufgefunden.</strong><p> Das vergangene Jahr erwies sich als ein weiterer Wendepunkt für das Virus, als es in Hunderten von US-<a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Rinderherden" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Rinderherden</span></a> und bei <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Arbeiter" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Arbeiter</span></a>n, die diese betreuten, nachgewiesen wurde. Mittlerweile ist klar, dass es keinen Grund für Optimismus gibt, dass H5N1 als geringfügiges Ärgernis verschwinden wird. Im Gegenteil, die Situation hat sich nur verschlechtert.</p><p> Da viele Anzeichen auf eine zukünftige <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Grippepandemie" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Grippepandemie</span></a> hindeuten, wird der Schlüssel zur Bekämpfung darin bestehen, einen freien Datenfluss zu gewährleisten, der eine Frühwarnung ermöglicht, und die Ressourcen für umfassende Tests und die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Analyse" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Analyse</span></a> der genetischen Entwicklung von H5N1 zu erhöhen. Dies muss sowohl global als auch national geschehen – aber an einem kritischen Punkt hat Präsident Donald <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Trump" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Trump</span></a> die Vereinigten Staaten stattdessen von den internationalen Gesundheitsbemühungen zurückgezogen und seinen Fehltritt noch verschlimmert, indem er die Kommunikation, die Kapazitäten und die Budgets der nationalen <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gesundheitsbeh%C3%B6rden" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Gesundheitsbehörden</span></a> ins Visier nahm. Die Wahrscheinlichkeit steigt, dass die Welt eine Gelegenheit verpasst, eine potenzielle <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Pandemie" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Pandemie</span></a> zu bekämpfen, bevor sie ausbricht.</p><p> Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Infektion" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Infektion</span></a> mit dem <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Vogelgrippevirus" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Vogelgrippevirus</span></a> hat sich mit beispielloser Geschwindigkeit bei Wild- und Hausvögeln sowie bei <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Meeress%C3%A4uger" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Meeressäuger</span></a>n und <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Lands%C3%A4ugetiere" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Landsäugetiere</span></a>n ausgebreitet. Bei einem jüngsten und beängstigenden Vorfall Ende 2024 starben von den 37 <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gro%C3%9Fkatzen" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Großkatzen</span></a>, die in einem Schutzgebiet in <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Shelton" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Shelton</span></a>, <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Washington" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Washington</span></a>, untergebracht waren, darunter <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Pumas" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Pumas</span></a>, <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Rotluchse" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Rotluchse</span></a> und <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Tiger" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Tiger</span></a>, 20 an einer Infektion mit dem Virus, die meisten innerhalb von 24 Stunden. H5N1 scheint sich durch <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Atemwegssekrete" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Atemwegssekrete</span></a> und den Kontakt mit infizierten <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Zugv%C3%B6gel" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Zugvögel</span></a>n verbreitet zu haben.</p><p> Der Silberstreif am Horizont von H5N1 ist, dass <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Menschen" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Menschen</span></a>, die erkrankten Tieren ausgesetzt sind, sich zwar mit dem Virus anstecken können, aber nach dem derzeitigen Kenntnisstand der Forscher nicht ohne Weiteres andere Menschen infizieren können. Das könnte sich jedoch ändern, wenn die Infektionszahlen in die Höhe schnellen. Das Virus stellt eine ernsthafte <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Bedrohung" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Bedrohung</span></a> dar.</p><p> Experten für öffentliche <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gesundheit" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Gesundheit</span></a> waren zu Recht besorgt, als das Virus 2024 in US-<a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Milchviehbest%C3%A4nden" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Milchviehbeständen</span></a> auftauchte. Es hat die Hälfte der fast 1.000 Menschen getötet, die sich seit Anfang der 2000er Jahre damit infiziert haben, überwiegend in <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/S%C3%BCdostasien" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Südostasien</span></a>. Dort konnte es sich rasch ausbreiten und bisher fast tausend Herden infizieren. Anders als bei Wildvögeln oder anderen <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Tierart" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Tierart</span></a>en arbeiten Menschen eng mit <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Milchvieh" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Milchvieh</span></a> zusammen. Menschen haben sich das Virus auch direkt von Vögeln eingefangen. Während <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Milchbauern" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Milchbauern</span></a> bisher nur leichte Infektionen erlitten haben, verliefen die Erkrankungen von zwei Personen, die sich bei toten oder infizierten Wild- oder Hausvögeln mit dem Virus angesteckt hatten, weitaus schlimmer. Ein Patient aus <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Louisiana" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Louisiana</span></a> starb; ein anderer in British Columbia erholte sich nur nach einem außergewöhnlichen medizinischen Eingriff. In beiden Fällen zeigten virale <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/RNA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>RNA</span></a>-Sequenzen <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Mutation" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Mutation</span></a>en, die eine effektive Bindung an Zellen in den menschlichen Atemwegen ermöglichen könnten. Bei Rindern und zahlreichen anderen Tierarten erhält das Virus zahlreiche Gelegenheiten, sich weiterzuentwickeln und gefährlicher zu werden.</p><p> Besonders besorgniserregend: Wenn zwei verschiedene <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Virusst%C3%A4mme" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Virusstämme</span></a> einen einzelnen Wirt gleichzeitig infizieren, können sie Teile ihres <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Genoms" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Genoms</span></a> austauschen, ein Prozess, der als <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> bezeichnet wird. Dadurch kann ein neues Virus mit einer anderen Kombination von Eigenschaften entstehen. Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Schweinegrippe" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Schweinegrippe</span></a>-Epidemie (<a href="https://mastodon.trueten.de/tags/H1N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H1N1</span></a>) von 1985 bis 1989 wurde beispielsweise durch ein Virus verursacht, das durch den Austausch von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Genomsegment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Genomsegment</span></a>en in einem <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Schwein" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Schwein</span></a> entstand, das gleichzeitig mit einem menschlichen und einem <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Vogelvirusstamm" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Vogelvirusstamm</span></a> infiziert war. Diese Art der Vermischung bei Tieren wird durch den aktuellen Ausbruch der <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Vogelgrippe" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Vogelgrippe</span></a>, der parallel zu einer extrem starken saisonalen <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Grippewelle" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Grippewelle</span></a> auftritt, immer wahrscheinlicher.</p><p> Derzeit werden die meisten Tests auf H5N1 bei symptomatischen Fällen durchgeführt. Infizierte Tiere und Menschen können jedoch bereits Tage vor dem Auftreten von Symptomen eine hohe <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Viruslast" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Viruslast</span></a> aufweisen. Arbeiter in Milch- und Geflügelfarmen zögern jedoch, sich testen zu lassen, aus Angst, ihren <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Arbeitsplatz" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Arbeitsplatz</span></a> zu verlieren. Obwohl die Centers for Disease Control and Prevention (CDC) kürzlich ihre Empfehlungen geändert haben, um sicherzustellen, dass auch asymptomatische <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Landarbeiter" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Landarbeiter</span></a> getestet werden, ist die Anzahl der durchgeführten Tests nach wie vor unzureichend. Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/CDC" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>CDC</span></a> hat sich kürzlich mit kommerziellen Testlabors zusammengetan, um die Überwachung zu verbessern, und auch einzelne Bundesstaaten führen vermehrt Tests an <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Milch" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Milch</span></a> asymptomatischer Herden durch.</p><p> Es sind aggressive Tests zur <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Fr%C3%BCherkennung" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Früherkennung</span></a> einer auf den Menschen übertragbaren Form von H5N1 erforderlich, aber das ist nur ein Teil eines jeden notwendigen Reaktionsplans: Überwachung ohne <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Kommunikation" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Kommunikation</span></a> ist nutzlos. Die Trump-Regierung hat im Rahmen eines allgemeinen Angriffs auf den Haushalt von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gesundheitsbeh%C3%B6rden" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Gesundheitsbehörden</span></a> und deren wissenschaftliche Unabhängigkeit versucht, die Kommunikation im Bereich der öffentlichen Gesundheit auf Bundesebene einzuschränken – selbst bei lebenswichtigen Informationen über H5N1.</p><p> Nach der Amtseinführung verhinderte die Regierung die Veröffentlichung des viel gepriesenen <em>Morbidity and Mortality Weekly Report der CDC, </em>der seit Jahrzehnten regelmäßig und auch nach einem Präsidentenwechsel ohne Unterbrechung veröffentlicht worden war. Die erste Ausgabe nach der Amtseinführung sollte angeblich <a href="https://thebulletin.org/2025/01/the-trump-administrations-health-communications-pause-is-unique/" rel="nofollow noopener" target="_blank">Studien über</a> H5N1 enthalten. Als die Veröffentlichung wieder aufgenommen wurde, waren diese nicht enthalten (obwohl <a href="https://www.npr.org/sections/shots-health-news/2025/02/13/nx-s1-5296672/cdc-bird-flu-study-mmwr-veterinarians" rel="nofollow noopener" target="_blank">eine inzwischen veröffentlicht wurde</a>, in der das <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Infektionsrisiko" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Infektionsrisiko</span></a> für Tierärzte, die mit infizierten Tieren arbeiten, aufgezeigt wird).</p><p> Seitdem sickern Daten aus verschiedenen Quellen durch.</p><p> Anfang dieses Monats gab das <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Landwirtschaftsministerium" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Landwirtschaftsministerium</span></a> bekannt, dass ein zweiter H5N1-Stamm von Vögeln auf drei <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Milchviehherden" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Milchviehherden</span></a> in <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Nevada" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Nevada</span></a> übergesprungen war. Dabei handelte es sich um den tödlicheren D1.1-Stamm, der Mutationen aufweist, die eine leichtere Ausbreitung des Virus bei Säugetieren ermöglichen könnten, im Gegensatz zum milderen B3.13-Stamm, der seit letztem Sommer Herden infiziert. Die Kühe in Nevada zeigten bei den Tests keine Symptome, aber die frühzeitige Erkennung durch das Milchuntersuchungsprogramm des <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Landwirtschaftsministerium" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Landwirtschaftsministerium</span></a>s von Nevada ermöglichte es den Beamten, die betroffenen Herden unter <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Quarant%C3%A4ne" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Quarantäne</span></a> zu stellen und so die Ausbreitung der <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Infektion" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Infektion</span></a> einzudämmen.</p><p> Da der gefährlichere D1.1-Stamm nun bei nordamerikanischen Zugvögeln vorherrscht, ist das, was in Nevada geschah – die zweite dokumentierte Übertragung von H5N1 von Vögeln auf Rinder – keine Überraschung. Es könnte jedoch sein, dass dieses Virus für Überraschungen sorgt, wenn die Tests bei nicht symptomatischen Menschen und Tieren weiterhin unzureichend sind, insbesondere da die Trump-Regierung die globale Zusammenarbeit der USA einschränkt und der <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Datenfluss" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Datenfluss</span></a> aus den USA und internationalen Organisationen, die Infektionen und die Entwicklung des Virus identifizieren, auf ein Rinnsal verlangsamt wird oder ganz zum Erliegen kommt.</p><p> Die CDC und die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Weltgesundheitsorganisation" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Weltgesundheitsorganisation</span></a> (WHO) sind maßgeblich daran beteiligt, die sich entwickelnde H5N1-Bedrohung im Auge zu behalten. Kein Teil der Welt ist vor zirkulierenden pandemischen Viren geschützt, und zu wissen, was sie sind und wo sie sich befinden, ist entscheidend für den Schutz der <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gesundheit" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Gesundheit</span></a> der Amerikaner und der Menschen auf der ganzen Welt.</p><p> In der Vergangenheit haben die CDC und die WHO einen aktiven <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Datenaustausch" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Datenaustausch</span></a> im Zusammenhang mit der globalen Krankheitsüberwachung betrieben. Die Kommunikation zwischen den Behörden erfolgte in Foren wie Beratungsgremien und Notfallteams. Ende Januar jedoch unterband die Trump-Regierung die Kommunikation zwischen CDC-Mitarbeitern und der WHO und zog Mitarbeiter ab, die <a href="https://www.cnn.com/2025/01/27/health/cdc-who-order/index.html" rel="nofollow noopener" target="_blank">in WHO-Büros</a> arbeiteten. Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Regierung" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Regierung</span></a> ordnete außerdem die Einstellung der finanziellen Unterstützung der USA für die WHO an, wobei diese Anordnung eine einjährige Schonfrist vorsieht. Die Anordnung, die Kommunikation einzustellen, trat jedoch sofort in Kraft. Die Vereinigten Staaten sind nicht mehr Teil der globalen Diskussion darüber, wie auf eine wachsende und potenziell explosive Krankheitsbedrohung reagiert werden soll. Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Amerikaner" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Amerikaner</span></a> haben den verlässlichen Einblick in das Verhalten von H5N1 außerhalb der US-Grenzen verloren und werden möglicherweise die Chance verpassen, Schutzmaßnahmen zu ergreifen.</p><p> Natürlich ist das globale <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Gesundheitssystem" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Gesundheitssystem</span></a> fehlerhaft. Die WHO und die CDC wurden für ihre Lücken und Verzögerungen bei der Vorsorge und Reaktion in den Tagen nach dem Auftreten von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/COVID19" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>COVID19</span></a> kritisiert. Die <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/WHO" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>WHO</span></a> wurde beschuldigt, zu einem Werkzeug politischer Agenden zu werden, und dafür kritisiert, dass sie erst dann <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Reisebeschr%C3%A4nkungen" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reisebeschränkungen</span></a> erlassen hat, als die Pandemie bereits weltweit wütete. Währenddessen verzögerte bei der CDC ein fehlerhafter <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/COVID" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>COVID</span></a>-Test, der frühzeitig veröffentlicht wurde, die genaue Meldung von Fällen. Das System muss repariert und nicht aufgegeben werden, insbesondere da die H5N1-Bedrohung weiter eskaliert.</p><p> Da die Zahl der mit dem <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Virus" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Virus</span></a> infizierten <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/V%C3%B6gel" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Vögel</span></a> und <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/S%C3%A4ugetier" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Säugetier</span></a>e weiterhin explosionsartig ansteigt, ist das Auftreten eines übertragbaren pandemischen Stammes keine Frage des „ob“, sondern des „wann“. Um Michael Osterholm, den Direktor des Zentrums für <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Infektionskrankheitenforschung" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Infektionskrankheitenforschung</span></a> und -politik an der Universität von <a href="https://mastodon.trueten.de/tags/Minnesota" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Minnesota</span></a>, zu zitieren: „Die Pandemieuhr tickt. Wir wissen nur nicht, wie spät es ist.“</p><p> Quelle: <a href="https://thebulletin.org/biography/lucy-shapiro/" rel="nofollow noopener" target="_blank">Lucy Shapiro</a>, 20. Februar 2025 in Bulletin of the Atomic Scientists: <a href="https://thebulletin.org/2025/02/the-bird-flu-outlook-has-only-gotten-worse" rel="nofollow noopener" target="_blank">The bird flu outlook has only gotten worse</a></p><p>Übersetzung: Thomas Trueten [Nicht authorisiert]</p><p><a href="https://mastodon.trueten.de/tags/CapitalismIsADeathCult" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>CapitalismIsADeathCult</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Neuraminidase" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Neuraminidase</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> and <a href="https://mstdn.science/tags/oseltamivir" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>oseltamivir</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/resistance" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>resistance</span></a> in clade 2.3.4.4b A(<a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a>) viruses circulating among <a href="https://mstdn.science/tags/Canadian" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Canadian</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/poultry" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>poultry</span></a>, 2024, <a href="https://etidiohnew.blogspot.com/2025/02/neuraminidase-reassortment-and.html" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidiohnew.blogspot.com/2025/0</span><span class="invisible">2/neuraminidase-reassortment-and.html</span></a> </p><p>Isolates from 8 farms reveal a mutation in the neuraminidase protein (H275Y) that is exceptionally rare among clade 2.3.4.4b viruses (present in 0.045% of publicly available clade 2.3.4.4b isolates). NA-H275Y is a well-known marker of resistance to the neuraminidase inhibitor oseltamivir.</p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Neuraminidase" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Neuraminidase</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> and <a href="https://mstdn.science/tags/oseltamivir" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>oseltamivir</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/resistance" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>resistance</span></a> in clade 2.3.4.4b A(<a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a>) viruses circulating among <a href="https://mstdn.science/tags/Canadian" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Canadian</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/poultry" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>poultry</span></a>, 2024, <a href="https://etidiohnew.blogspot.com/2025/02/neuraminidase-reassortment-and.html" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidiohnew.blogspot.com/2025/0</span><span class="invisible">2/neuraminidase-reassortment-and.html</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>Naturally occurring <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> in <a href="https://mstdn.science/tags/pigs" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>pigs</span></a> facilitates the emergence of intrahost virus subpopulations with distinct <a href="https://mstdn.science/tags/genotypes" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>genotypes</span></a> and replicative&nbsp;<a href="https://mstdn.science/tags/fitness" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>fitness</span></a></p><p>Source: mBio, ABSTRACTPigs are recognized as amplifying hosts for influenza A virus (IAV) reassortant viruses. Understanding the extent of IAV reassortment occurring at the individual pig level in naturally infected pigs and how reassortment impacts virus diversity, persistence, and replicative fitness is…</p><p><a href="https://etidioh.wordpress.com/2024/11/29/naturally-occurring-influenza-reassortment-in-pigs-facilitates-the-emergence-of-intrahost-virus-subpopulations-with-distinct-genotypes-and-replicative-fitness/" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidioh.wordpress.com/2024/11/</span><span class="invisible">29/naturally-occurring-influenza-reassortment-in-pigs-facilitates-the-emergence-of-intrahost-virus-subpopulations-with-distinct-genotypes-and-replicative-fitness/</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> of newly emergent clade 2.3.4.4b A(<a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a>) highly pathogenic avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> A viruses in&nbsp;<a href="https://mstdn.science/tags/Bangladesh" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Bangladesh</span></a>.</p><p>Source: Emerging Microbes and Infections, AbstractAvian influenza active surveillance was conducted in Bangladesh from January 2022 to November 2023 in live-poultry markets (LPMs) and Tanguar Haor wetlands. The predominant viruses circulating in LPMs were low pathogenic avian influenza (LPAI) A(H9N2) and clade 2.3.2.1a highly pathogenic avian influenza…</p><p><a href="https://etidioh.wordpress.com/2024/11/25/reassortment-of-newly-emergent-clade-2-3-4-4b-ah5n1-highly-pathogenic-avian-influenza-a-viruses-in-bangladesh/" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidioh.wordpress.com/2024/11/</span><span class="invisible">25/reassortment-of-newly-emergent-clade-2-3-4-4b-ah5n1-highly-pathogenic-avian-influenza-a-viruses-in-bangladesh/</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>Revealing <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> in <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> A viruses with&nbsp;TreeSort</p><p>Source: BioRxIV, AbstractReassortment among influenza A viruses (IAV) facilitates genomic evolution and has been associated with interspecies transmission and pandemics. We introduce a novel tool called TreeSort that accurately identifies recent and ancestral reassortment events on datasets with thousands of IAV whole genomes. The algorithm has immediate relevance to modern large-scale surveillance studies…</p><p><a href="https://etidioh.wordpress.com/2024/11/17/revealing-reassortment-in-influenza-a-viruses-with-treesort/" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidioh.wordpress.com/2024/11/</span><span class="invisible">17/revealing-reassortment-in-influenza-a-viruses-with-treesort/</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Phylogenetic" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Phylogenetic</span></a> Insights into <a href="https://mstdn.science/tags/H7Nx" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H7Nx</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/Influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Influenza</span></a> Viruses: Uncovering <a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/Patterns" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Patterns</span></a> and Geographic&nbsp;Variability</p><p>Source: Viruses, AbstractInfluenza A viruses (IAVs), which belong to the Orthomyxoviridae family, are RNA viruses characterized by a segmented genome that allows them to evolve and adapt rapidly. These viruses are mainly transmitted by wild waterfowl. In this study, we investigated the evolutionary processes of H7Nx (H7N1, H7N2, H7N3, H7N4, H7N5, H7N6,…</p><p><a href="https://etidioh.wordpress.com/2024/10/23/phylogenetic-insights-into-h7nx-influenza-viruses-uncovering-reassortment-patterns-and-geographic-variability/" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidioh.wordpress.com/2024/10/</span><span class="invisible">23/phylogenetic-insights-into-h7nx-influenza-viruses-uncovering-reassortment-patterns-and-geographic-variability/</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>Complex Evolutionary <a href="https://mstdn.science/tags/Dynamics" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Dynamics</span></a> of <a href="https://mstdn.science/tags/H5N8" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N8</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/Influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Influenza</span></a> A Viruses Revealed by Comprehensive <a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a>&nbsp;<a href="https://mstdn.science/tags/Analysis" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Analysis</span></a></p><p>Source: Viruses, AbstractInfluenza A viruses (IAVs) circulate among different species and have the potential to cause significant pandemics in humans. This study focuses on reassortment events in the H5N8 subtype of IAV, which poses a serious threat to public health due to its high pathogenicity in birds and potential for cross-species transmission. We…</p><p><a href="https://etidioh.wordpress.com/2024/09/29/complex-evolutionary-dynamics-of-h5n8-influenza-a-viruses-revealed-by-comprehensive-reassortment-analysis/" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">etidioh.wordpress.com/2024/09/</span><span class="invisible">29/complex-evolutionary-dynamics-of-h5n8-influenza-a-viruses-revealed-by-comprehensive-reassortment-analysis/</span></a></p>
Giuseppe Michieli<p>Complex Evolutionary <a href="https://mstdn.science/tags/Dynamics" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Dynamics</span></a> of <a href="https://mstdn.science/tags/H5N8" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N8</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/Influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Influenza</span></a> A Viruses Revealed by Comprehensive <a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> Analysis <a href="https://www.mdpi.com/1999-4915/16/9/1405" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="">mdpi.com/1999-4915/16/9/1405</span><span class="invisible"></span></a> </p><p>This detailed case study of specific H5N8 viruses revealed previously undescribed reassortment events, highlighting the complex evolutionary history and potential pandemic threat of H5N8 IAVs.</p>
Giuseppe Michieli<p>Incompatible <a href="https://mstdn.science/tags/packaging" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>packaging</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/signals" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>signals</span></a> and impaired <a href="https://mstdn.science/tags/protein" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>protein</span></a> functions hinder <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> of <a href="https://mstdn.science/tags/bat" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>bat</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/H17N10" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H17N10</span></a> or <a href="https://mstdn.science/tags/H18N11" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H18N11</span></a> segment 7 with <a href="https://mstdn.science/tags/human" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>human</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/H1N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H1N1</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> A viruses, J Virol.: <a href="https://journals.asm.org/doi/abs/10.1128/jvi.00864-24?af=R" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">journals.asm.org/doi/abs/10.11</span><span class="invisible">28/jvi.00864-24?af=R</span></a> </p><p>Recombinant PR8 viruses with bat influenza M open reading frames were generated but showed attenuation, which correlated with the functions of the bat M2 protein. Our studies provide novel insights into the molecular mechanisms that restrict reassortment between bat and conventional IAVs.</p>
Giuseppe Michieli<p>The <a href="https://mstdn.science/tags/cold" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>cold</span></a>-inducible <a href="https://mstdn.science/tags/RNA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>RNA</span></a>-binding <a href="https://mstdn.science/tags/protein" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>protein</span></a> RBM3 stabilises viral <a href="https://mstdn.science/tags/mRNA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>mRNA</span></a> at the cooler <a href="https://mstdn.science/tags/temperatures" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>temperatures</span></a> of the upper <a href="https://mstdn.science/tags/respiratory" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>respiratory</span></a> tract, BioRxIV: <a href="https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.25.605104v1" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="ellipsis">biorxiv.org/content/10.1101/20</span><span class="invisible">24.07.25.605104v1</span></a> </p><p>These data suggest a role for RBM3 in supporting <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> virus replication in the nasopharyngeal tract. Understanding IAV replication in this environment could prove fundamental to elucidating the mechanisms of influenza <a href="https://mstdn.science/tags/transmission" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>transmission</span></a> and <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a>.</p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Genomic" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Genomic</span></a> Characterization of <a href="https://mstdn.science/tags/HPAI" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>HPAI</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a> Virus Newly Emerged in Dairy <a href="https://mstdn.science/tags/Cattle" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Cattle</span></a>, Emerg Microbes Infect.: <a href="https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2024.2380421" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="ellipsis">tandfonline.com/doi/full/10.10</span><span class="invisible">80/22221751.2024.2380421</span></a> </p><p>B3.13 viruses underwent 2 <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> events since 2023 &amp; exhibit critical <a href="https://mstdn.science/tags/mutations" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>mutations</span></a> in <a href="https://mstdn.science/tags/HA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>HA</span></a>, <a href="https://mstdn.science/tags/M1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>M1</span></a>, &amp; <a href="https://mstdn.science/tags/NS" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>NS</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/genes" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>genes</span></a> but lack critical mutations in <a href="https://mstdn.science/tags/PB2" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>PB2</span></a> &amp; PB1 genes, which enhance virulence or adaptation to <a href="https://mstdn.science/tags/mammals" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>mammals</span></a>. <a href="https://mstdn.science/tags/PB2" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>PB2</span></a> E627 K mutation in a <a href="https://mstdn.science/tags/human" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>human</span></a> case associated with cattle underscores the potential for rapid evolution post-infection...</p>
Giuseppe Michieli<p><a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> incompetent live attenuated and replicon <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/vaccines" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>vaccines</span></a> provide improved <a href="https://mstdn.science/tags/protection" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>protection</span></a> against <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> in <a href="https://mstdn.science/tags/piglets" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>piglets</span></a>, npj Vaccines: <a href="https://www.nature.com/articles/s41541-024-00916-x" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="ellipsis">nature.com/articles/s41541-024</span><span class="invisible">-00916-x</span></a> </p><p>Our novel vaccines may aid in interrupting continuous IAV transmission chains in large enzootically infected pig herds, improve the health status of the animals, and reduce the risk of zoonotic swIAV transmission.</p>
Giuseppe Michieli<p>Novel <a href="https://mstdn.science/tags/Genotypes" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Genotypes</span></a> of <a href="https://mstdn.science/tags/HPAI" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>HPAI</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a> Clade 2.3.4.4b Viruses, <a href="https://mstdn.science/tags/Germany" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Germany</span></a>, November 2023, Emerg Infect Dis.: <a href="https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/30/8/24-0103_article" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">wwwnc.cdc.gov/eid/article/30/8</span><span class="invisible">/24-0103_article</span></a> </p><p>Several <a href="https://mstdn.science/tags/subtypes" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>subtypes</span></a> &amp; many different genotypes of HPAI viruses of subtype <a href="https://mstdn.science/tags/H5" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5</span></a> clade 2.3.4.4b have repeatedly caused <a href="https://mstdn.science/tags/outbreaks" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>outbreaks</span></a> in Germany. 4 new HPAI genotypes emerged in Nov 2023 after <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> with low pathogenicity precursors, replacing genotype BB, which had dominated in Europe since 2022.</p>
Giuseppe Michieli<p>Red knots in <a href="https://mstdn.science/tags/Europe" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Europe</span></a>: a dead end <a href="https://mstdn.science/tags/host" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>host</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/species" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>species</span></a> or a new <a href="https://mstdn.science/tags/niche" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>niche</span></a> for highly pathogenic avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a>? Open Access, J Gen Virol.: <a href="https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/jgv/10.1099/jgv.0.002003" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="ellipsis">microbiologyresearch.org/conte</span><span class="invisible">nt/journal/jgv/10.1099/jgv.0.002003</span></a> </p><p>While mechanisms of virus circulation in potential reservoir species, dynamics of spill-over &amp; <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> events &amp; roles of environmental virus sources remain to be identified, year-round infection pressure poses severe <a href="https://mstdn.science/tags/threats" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>threats</span></a> to endangered avian species &amp; prompts adaptation of habitat &amp; species <a href="https://mstdn.science/tags/conservation" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>conservation</span></a> practices.</p>
Giuseppe Michieli<p>Genetic <a href="https://mstdn.science/tags/Reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Reassortment</span></a> in a <a href="https://mstdn.science/tags/Child" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Child</span></a> Coinfected with Two <a href="https://mstdn.science/tags/Influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Influenza</span></a> B Viruses, B/ <a href="https://mstdn.science/tags/Yamagata" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Yamagata</span></a> Lineage and B/ <a href="https://mstdn.science/tags/Victoria" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Victoria</span></a>-Lineage Strains, Viruses: <a href="https://www.mdpi.com/1999-4915/16/6/983" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://www.</span><span class="">mdpi.com/1999-4915/16/6/983</span><span class="invisible"></span></a> </p><p>In a part of <a href="https://mstdn.science/tags/Japan" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Japan</span></a>, where two influenza B lineages co-circulated, we encountered a child coinfected with these two lineages in 2016. Here, we demonstrate that genetic reassortment occurred between them within this child.</p>
Giuseppe Michieli<p>Avian <a href="https://mstdn.science/tags/influenza" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>influenza</span></a> virus <a href="https://mstdn.science/tags/NA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>NA</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/stalk" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>stalk</span></a> length &amp; <a href="https://mstdn.science/tags/HA" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>HA</span></a> <a href="https://mstdn.science/tags/glycosylation" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>glycosylation</span></a> patterns reveal molecularly directed <a href="https://mstdn.science/tags/reassortment" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>reassortment</span></a> promoting emergence of highly pathogenic <a href="https://mstdn.science/tags/clade" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>clade</span></a> 2.3.4.4b A (<a href="https://mstdn.science/tags/H5N1" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>H5N1</span></a>) viruses <a href="http://biorxiv.org/cgi/content/short/2024.05.22.595329v1?rss=1" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">http://</span><span class="ellipsis">biorxiv.org/cgi/content/short/</span><span class="invisible">2024.05.22.595329v1?rss=1</span></a> </p><p>These observations led us to establish and validate hypothesis that pairing of avian virus HA &amp; NA subtypes is not stochastic but is rather molecularly programmed by HA glycosylation &amp; NA stalk length, modulating fitness &amp; emergence of novel avian influenza viruses.</p>